本16S rRNA基因扩增子测序数据分析流程包括：首先对样本测序数据进行质控与预处理；然后得到样本的OTU聚类与物种分类信息；在查看样品的细菌种类后，统计每个样品的差异菌种。For more details about 16S rRNA analysis, recommend following the tutorial: https://rachaellappan.github.io/16S-analysis/index.html
Please note that QIIME1 and the 97% OTU-based workflow has been superseded by ASVs (100% OTUs) and the QIIME2 workflow!
一般我们是通过命令行界面来使用Linux服务器，但有时也需要用Linux图形界面的软件，如IGV。当需要显示的基因组信息比较大，如测序reads的基因组比对情况，会占用大量内存，在服务器上运行会比较流畅。下面是本地windows电脑显示远程Linux服务器桌面的方法。
C语言是一门通用的计算机编程语言，广泛应用于系统与应用软件的开发。它是由Dennis Ritchie与Ken Thompson于1969年至1973年间，为了移植与开发UNIX操作系统，在贝尔实验室设计与开发。C语言具有高效、灵活、功能丰富、表达力强和可移植性好等特点。C语言的设计影响了众多后来的编程语言，例如C++、Objective-C、Java、C#等。
Welcome to Hexo! This is your very first post. Check documentation for more info. If you get any problems when using Hexo, you can find the answer in troubleshooting or you can ask me on GitHub.
科研似乎是比较高大上的词，但英文“research”更能表达它的意思，就是反复(re)搜索(search)文献。大牛牛顿都说他的成功是站在巨人的肩膀上(Stand on the shoulders of giants)。从事科研都要先查文献，看看别人做了什么或先学习怎么做，运气好的，如获诺奖的菁蒿素就是屠youyou从我国传统医学文化宝库的古籍堆里找到的秘方，才被提取用于疟疾的治疗。
数据分析中常碰见多重检验(multiple testing)问题，如利用基因芯片数据比较分析两个样品间是否有差异表达基因，或利用质谱定量数据鉴定某一个蛋白在两个样品中是否存在差异表达等。
一般选取差异表达基因有两标准：
(1) Fold Change，即两个样品中同一个基因的表达水平变化倍数;
(2) p-value，即通过T检验等统计学方法计算每个基因的P值。
A guru of biostar.org predict the future of bioinformatics will need Javascript programming.
基因组组装会得到许多contigs，一般需要将它们比对到参考基因组序列，以确定contigs在染色体的位置。
参考基因组可以用亲缘关系很近的物种序列，例如同一个物种的不同菌株测序，可以用该种模式菌株的基因组序列作为reference sequence。