基因组组装会得到许多contigs，一般需要将它们比对到参考基因组序列，以确定contigs在染色体的位置。
参考基因组可以用亲缘关系很近的物种序列，例如同一个物种的不同菌株测序，可以用该种模式菌株的基因组序列作为reference sequence。

Linux下最新版BLAST+的本地化安装与基本使用用法。
BLAST的更详细使用方法可参考BLAST手册《BLAST Command Line Applications User Manual》，网址：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK279690/

Windows记事本的功能比较弱，有时不能胜任文本数据处理，如打开大文件会很慢、不能识别Linux系统的换行符等。
Notepad2是一款优秀的轻量级文本编辑器，而Notepad2-mod又增强了一些功能，如语法高亮、代码折叠、自动代替Windows记事本等。
修改版的下载地址：https://xhmikosr.github.io/notepad2-mod/

第一篇博文，记录此博客的搭建过程。