终端(Terminal)为macOS使用命令行的界面，与Linux基本命令相同，但是软件安装存在一些差异。

终端

  • Mac电脑如何打开终端：command+空格 在聚焦搜索中输入terminal回车。

  • macOS环境变量配置与Linux系统配置方法一致，但配置文件为用户主目录下的“.bash_profile”。
    $vim ~/.bash_profile

  • 编辑完成并保存后，需要运行source命令。
    $source ~/.bash_profile

  • 手动安装XCODE Command Line Tools:
    $xcode-select –install

macOS的包管理器Homebrew

macOS安装Homebrew只需要在终端运行以下一行命令：
$/usr/bin/ruby -e “$(curl -fsSL https://raw.githubusercontent.com/Homebrew/install/master/install)"
因国外的网址较慢，如不能安装，可使用国内的网址进行安装：
$/bin/zsh -c “$(curl -fsSL https://gitee.com/cunkai/HomebrewCN/raw/master/Homebrew.sh)"

  • Homebrew安装软件的方法：
    $brew install bwa

Miniconda

Mac电脑上conda配置与创建虚拟环境与Linux系统相同。